数字档案馆建设是一个高技术含量的档案馆建设，需要一系列基础工作的支持，而我们国家在信息技术基础方面比较薄弱，又加之我国数字档案馆建设起步较晚，因此，数字档案馆的建设在实践中面临诸多艰巨问题，包括以下几方面：
（一）从思想观念上看，传统人文意识与档案信息网络化存在矛盾
中国传统的档案工作具有 “纵向隶属”、“封闭隔绝”特点，而数字档案馆是基于档案信息网络的档案馆，必须崇尚网络精神，具备开放意识，注重科学系统性，加强纵横联系。所以此时传统人文意识与开放的档案信息网络化就形成尖锐的矛盾。目前，传统意识在我们的数字档案馆建设工作中仍可以彰显出弊端，具体表现为：缺乏系统的思维观念横向联系少，协调能力弱，档案信息资源共享网络建设阻碍重重，档案信息数据库建得不少但高质量的寥寥无几等等。种种迹象表明，如果没有思想观念上的大转变，数字档案馆建设很难取得成功。
（二）从投入资金上看，政府资金的支持力度与数字档案馆的建设投入脱节
数字档案馆的建设是一个高投入的系统项目，没有政府的支持很难获得成功。由于我国正处于经济建设、改革发展期，各行各业都需要国家的财力支援，国家虽然对数字档案馆的建设提供了一些财力支持，但这与数字档案馆的建设所需相差甚远。目前连基本的档案事业费都难以保证的档案馆还为数不少。在这种资金匮乏的状况下，数字档案馆的大规模系统性建设计划只能放长远一些，数字档案馆建设的成功还需要一个相当长的历史过程。
（三）,从数据库建设上看，档案信息数据库建设水准与数字档案馆的要求差距悬殊
这主要有以下几方面表现：绝对数量多，优质数量少，资源浪费严重；规范化和标准化程度低，标引与检索点选取没有严格的质量控制，各自为政；数据库类型比较单一，档案信息目录数据库居多，其他全文型、多媒体档案信息数据库偏少，难以满足用户实际需求；印刷型档案数量庞大，数字化转换工作不容乐观等等。
（四）从网络基础上看，网络通信速度无法满足数字档案馆的广泛使用
数字档案馆是借助于网络开展服务的，在这里，网络通信速度就成了数字档案馆利用效率的关键。目前，在我国大部分地区，网络通道不畅，主干道带宽不足，上网速度较慢；此外，对我国用户来说还背负着一个昂贵的上网费问题。一般的家庭上网，中小城市每月网费大概七八十左右，像北京等大城市的网费则高达每月120元以上。
（五）从研究开发上看，网络档案信息保存技术的研究进展缓慢
数字档案信息的长期安全保存涉及到格式、媒体的转换以及随技术更新对保存的档案信息进行了迁移等问题，具有很高的技术性。只有在数字技术高度发展的前提下，这个难题才能攻破。目前我国对数字档案信息长期保存的研究较少。数字技术的高度发展还尚待时日，这势必会影响数字档案馆建设的进程。
总之，由于国情和条件的限制，数字档案馆在我国的发展任重而道远。因此，档案馆在明确数字档案馆为档案馆发展方向的同时，还仍然需要扎扎实实地处理实体档案馆的一切业务，而且业务工作特别是档案信息数据库建设心更标准化和规范化，并在档案信息资源建设中坚持电子型、数字型和印刷型并举，为数字档案馆的成功构建打下坚实的基础。
