数字档案馆与传统的实体档案馆既有区别，也有密切的联系，两者之间是一种互为补充、互相依存的关系。这一问题可以从以下两个方面理解：
（一）数字档案馆不能取代传统的实体档案馆。
网络环境下社会对档案信息传播和需求的增加，使得传统的实体档案馆难以用原来的管理方法和技术应对，这造成一些人断言传统的实体档案馆将被管理方法和技术更先进的数字档案馆所取代。
其实，数字档案馆只是逐步取代传统的实体档案馆的中心地位成为未来档案馆的主体，但这并不意味着能够完全取代传统的实体档案馆，原因有以下几个方面：
1, 数字档案馆的建设需要大量的资金和人力、物力的投入，将传统档案馆全部建设成为数字档案馆是不现实的。
2, 一些年代久远、具有历史价值或凭证价值的档案原件，其所具有的空间感、时间感与真实感是无法通过计算机模拟的。在虚拟的空间建起来了电子模型远不如原物更能展现历史的真实面目，所以这类档案仍要依赖传统档案馆得到妥善保存。
3,用户的计算机操作能力、经济能力、长期养成的阅读习惯和阅读心理，仍会使其去传统档案馆翻阅档案原件。
4, 传统的实体档案馆不仅是档案的保管查阅场所，还是学术交流、咨询信息的社会交流场所，其所具有的人文和历史精神是数字档案馆不可能具备的。传统的实体档案馆作为一种社会文化设施将永远存在。
（二）数字档案馆和传统的实体档案馆相互依存。
在目前阶段，数字档案馆与传统的实体档案馆各自存在着优缺点，二者必须互相依存才能共同发展。
第一，从档案信息资源建设角度来讲，传统的实体档案馆馆藏档案原件是数字档案馆数字化档案信息的重要来源。传统的实体档案馆保存档案经由数字化加工，进入数字档案信息资源库，成为数字档案馆数字化档案信息中最基本的、重要的核心组成部分。可以说，离开了这一来源，数字档案馆将难以构建完整的、有权威的信息资源库；同时，数字档案馆的系统建设也可以促使并指导传统档案馆进一步科学地丰富馆藏，有利于传统的实体档案馆对那些散存的重要档案以及其他专门专业档案信息的收集。
第二，从档案信息真迹的保护角度来讲，根据目前科学技术发展的水平来看，传统的实体档案馆比数字档案馆更能保证档案的安全性。档案数字化以后可以完整地、不留痕迹地被复制和修改；计算机病毒、磁场、电磁脉冲等都对数字化的档案具有破坏性。尽管问题可以采取较先进的技术得到有效的控制，但难以从根本上杜绝。在这一方面，传统的实体档案馆是数字档案馆的有益补充。
第三，从档案信息的加工角度来讲，数字档案馆的自动化处理虽节省了人力物力，但仍需要传统的实体档案馆为其信息加工提供支持。传统的实体档案馆馆藏档案信息经过数字化加工之后自动生成各种类型的信息目录或较简单的档案参考资料。然而深层次的档案编研成果及馆藏档案资料编制的图片、音像等多媒体参考资料，还是需要依靠传统档案馆来进行。
第四，从档案信息资源的开发利用角度来讲，数字档案馆弥补了传统档案馆的不足。传统的实体档案馆由于缺乏强有力的开发利用手段，受时间和空间的局限而不能迅速、广泛地为社会提供档案信息服务，限制了档案信息价值的发挥。而数字档案馆凭借网络优势，在极广阔的范围内发布数字档案信息，不受时间、地域的限制，提供快捷、方便的服务，实现档案信息资源共享。
